Por sustitución de bases: son alteraciones en la secuencia de nucleótidos de un gen y se conocen dos tipos; Transiciones o transversiones.
Por pérdida o inserción de nucleótidos: son modificaciones en donde se puede perder o agregar una base nitrogenada, la cual es importante para codificar a una proteína específica y por lo tanto cambia el mensaje del material genético.
Deleción: Pérdida de un fragmento de cromosoma.
Duplicación: Repetición de un fragmento de cromosoma.
Inversión: Cambio de sentido de un fragmento de cromosoma.
Translocación: Cambio de posición de un segmento de cromosoma.